2016具備自主招生資格的95所高校名單如下：

北京（24所）：北京大學(含北大醫學部）、中國人民大學、清華大學、北京交通大學、北京科技大學、北京化工大學、北京郵電大學（含北京郵電大學宏福校區）、北京林業大學、北京中醫藥大學、北京師范大學、北京外國語大學（16年不招生）、中國傳媒大學、中央財經大學、對外經濟貿易大學、中國政法大學、華北電力大學（含保定）、中國石油大學（北京）、北京航空航天大學、北京理工大學、中國農業大學（16年不招生）、北京語言大學、中國礦業大學·北京（16年不招生）、中國地質大學·北京（16年不招生）、北京工業大學(僅本市)

上海（9所）：復旦大學（含復旦大學上海醫學院）、上海交通大學（含上海交大醫學院）、華東理工大學、東華大學、華東師范大學、上海外國語大學、上海財經大學、同濟大學、上海大學(僅本市)

江蘇（11所）：南京大學、東南大學、中國礦業大學、河海大學、江南大學、南京農業大學、中國藥科大學、南京航空航天大學、南京理工大學、蘇州大學、南京師范大學(僅本省)

湖北（7所）：武漢大學、華中科技大學、中國地質大學（武漢）、武漢理工大學、華中農業大學、華中師范大學、中南財經政法大學

四川（5所）：四川大學、西南交通大學、電子科技大學(含電子科技大學沙河校區) 、西南財經大學、四川農業大學（僅本省）

陜西（7所）：西安交通大學、西安電子科技大學、長安大學、西北農林科技大學、陜西師范大學、西北工業大學、西北大學（僅本省）

山東（3所）：山東大學、中國海洋大學、中國石油大學（華東）

湖南（3所）：湖南大學、中南大學、湖南師范大學（僅本省）

廣東（2所）：中山大學、華南理工大學

重慶（3所）：重慶大學、西南大學、西南政法大學（僅本省）

天津（2所）：南開大學、天津大學

遼寧（3所）：大連理工大學、東北大學、大連海事大學

吉林（2所）：吉林大學、東北師范大學

浙江（1所）：浙江大學

安徽（2所）：中國科學技術大學、合肥工業大學（含合肥工業大學宣城校區）

福建（2所）：廈門大學、福州大學(僅本省)

甘肅（1所）：蘭州大學

黑龍江（4所）：哈爾濱工業大學、哈爾濱工程大學、東北林業大學（16年不招生）、黑龍江大學（僅本省）

河南（1所）：鄭州大學（僅本省）

廣西（1所）：廣西大學（僅本省）

貴州（1所）：貴州大學（僅本省）

云南（1所）：云南大學（僅本省）